화학/Inorganic chemistry (40) 썸네일형 리스트형 꼭 그렇게까지 산화 시켜야만 했냐! 철 7가, Iron(VII) 논문 발표 https://www.nature.com/articles/s41557-023-01418-4 얼마전 네이처 케미스트리에 철 7가를 만들었다는 논문이 올라왔다. 물론 무기화학자들이, organometallic 하는 양반들이 oxidation state에 관심 많은 게 하루 이틀 일도 아니지만 7가까지 산화시켰다는 제목을 보니 클릭을 안할 수가 없었다. 여전히 흥미로운 주제인 것은 맞다. 금속의 새로운 산화상태와 그 상태에서 기반한 새로운 반응성을 기대하는 것은 어느 전이금속이나 마찬가지니까. 그럼 여기서 그들은 어떻게 산화시키고, 어떻게 써먹었을까? 일단 착물은 엄청나게 bulky한 리간드를 사용해서 산화된 Fe가 다른 원자를 터치하면서 반응하지 않게 막아주게끔 했다. 일반적이지 않은 산화상태를 안정적으로 .. X-ray crystallography 관련 참고사항들 Flack parameter: Chiral molecule을 포함한 크리스탈의 Correct handness를 결정하기 위한 파라미터. Absolute configuration을 결정해야할 때 봐야하는 부분이다. 0 - 1.0 사이 값을 가지며 0에 가까울수록 refinement가 실제 구조에 맞게 되었음을 의미하며, 1에 가까워지면 구조를 뒤집어서 다시 refine 해야한다. 보통 매우 0에 가깝게 (0.001, 0.006 등) 나오면 잘 된 것이고, 만약 0도 1도 아닌 어중간한 값이 나온다면 매우 높은 가능성으로 크리스탈이 Twinned 된 상태일 가능성이 있다. Twinned crystal은 눈으로 보기에는 한 방향으로 잘 자란 크리스탈 같지만 분석해보니 다른 방향으로 정렬된 크리스탈이 붙어서 자.. Face indexed absorption correction, x-ray에서 크리스탈의 면면을 찍는 이유 우리가 위와 같이 예쁜 크리스탈을 얻어서 구조분석에 쓰려고 한다고 치자. 그러면 x-ray가 이 크리스탈을 쏘면서 반사되는 빛을 디텍터로 감지해서 그 패턴을 분석해야 하는데, 이 과정에서 보정이 들어가야 한다 (absorption correction). 모든 x-ray 광자가 결정과 부딪혀서 반사된다면 좋겠지만, 그대로 투과해서 디텍터로 가는 것도 있을 것이기 때문이다. 크리스탈이 구형이라면 어디에서 빛이 와서 반사를 하던 똑같기 때문에 필요가 없지만 우리가 구형의 크리스탈을 볼 일은 0에 가깝기 때문에, 여러 방향에서 오는 빛들을 다 구분해서 보정해줘야 한다. 그래서 위 사진에 나온 수많은 선 처럼 크리스탈의 면면을 최대한 가깝게 모방해서 이에 맞춰서 보정해주세요 하는 방법이 face-indexed a.. 음의 전하를 가진 금속 이온 착물도 만들 수 있을까? (Negative oxidation state) 일반화학이나 무기화학을 들었던 사람이라면 (혹은 우연치않게라도) NaCl에서 Na는 +를, Ca(OH)2에서 Ca는 2+를, K2PtCl4에서 Pt는 2+를 가진다는 것을 기억할 것이다. 금속은 최외각전자를 잃어서 intert gas의 전자배치를 따라가려 한다는 사실을 기억할 것이다. 그리고 전자를 잃는 것이 더 유리한 이유는 얻어서 inert gas의 전자배치를 하는 것보다 잃어서 inert gas의 전자배치가 되는 것이 더 유리하기 때문이다. 이렇듯 착물들의 구조나 전하 상태를 생각해보면, 금속들은 항상 자기보다 전기음성도가 큰 원자들에 전자를 뺏겨서 양의 이온상태거나 혹은 중성 상태, 산화상태가 0인 상태로 안정화되어 세상에 나타나곤 한다. 절대 다수의 경우 리간드가 중성인 경우 다른 counter.. Olex software를 활용한 X-ray 구조 분석, 팁 1. A, B alerts는 https://checkcif.iucr.org/에서 comment를 달 수 있다. 에러가 무슨소리인지 알고 싶으면 에러코드인 PLAT###을 구글에 찾아보면 된다. 2. Comment를 넣는 곳은 .cif파일의 맨 마지막에 있다. pdf 파일로 받은 response form을 복사해서 붙여놓고 comment 란에 왜 이 alert는 심각하지 않은지 설명해주면 된다. 3. Chiral center를 가지고 있는 분자의 경우 absolute configuration을 넣으라고 하는 경우가 있는데 (PLAT 035), 이는 .cif 파일에서 수정할 수 있다. .cif 파일을 열면 _chemical_absolute_configuration ? 라는 곳이 있고, ?에 SYN으로 넣으면.. 이번 주의 무기화학 - 불소 이온 (F-)는 어떻게 치아를 보호할까? 치약 속 불소의 역할 최근에 문득 불소에 대한 궁금증이 생겼다. 어렸을 때 주기적으로 불소 가글? 을 학교에서 했던 것부터, 수돗물에 불소가 들어있는 것까지 생활 곳곳에 불소가 많이 사용되고 있는데, 그냥 치아에 좋다더라 하고 넘어갔던 것 같다. 근데 이제서야 다시 생각을 해보니 이게 왜 어떤 메커니즘으로 보호를 해주는건지 궁금했다. 적당히 나오는 결과로는 에나멜을 불소가 보호해준다는 것이었는데, 더 아리송해져서 더 깊은 메커니즘을 찾아보았다. https://www.dentalcare.com/en-us/ce-courses/ce94/mechanism-of-action-of-fluoride 찾아본 결과를 요약하자면, 불소가 치아의 치아 표면을 코팅하여 손상되는 것을 막아준다는 것이다. 여기서 불소이온이 OH- (hydroxyl .. 이전 1 2 3 4 ··· 7 다음
